تخضع عملية التوجيه إلى شعبة التربية البدنية بالنسبة لباكالوريا غير الرياضة إلى عدة شروط منها حصول المترشح على معدل 16 من 20 في مادة التربية البدنية. ويتم تسجيل الطلبة الموجهين للدراسة بالمعاهد العليا للرياضة والتربية البدنية على إثر النجاح في الاختبار الطبي المعمق الذي يتعين على المترشح إجراؤه في أحد مراكز الطب وعلوم الرياضة خلال الفترة المتراوحة بين 26 جويلية و15 أوت 2012، بعد الحصول على موعد مسبق بالهاتف من المركز الأقرب إليه. وتوجد مراكز الطب وعلوم الرياضة بتونس ونابل والمنستير وسوسة والقيروان وقفصة والكاف وقابس وصفاقس. ولا تعتبر عملية التوجيه الجامعي نهائية إلا في صورة سلامة المترشح إثر الفحص الطبي المعمق.