يستمر التنافس المحلي والعالمي بين جامعات التعليم العالي والبحث العلمي المختلفة على مدار مسيرتها التعليمية، وتأخذ فيه مساعي هذه المؤسسات نحو المقدمة صورا وأشكالا متنوعة تبرز في جهود تعزيز البحث العلمي. إذا أردنا أن نتعرف على أفضل الجامعات في أحدث التصنيفات الصادرة فلدينا عدة تصنيفات مثل: تصنيف "URAP"، تصنيف "THE"، تصنيف "Webometrics"، تصنيف "Shanghai"، وتصنيف "QS". نشر موقع تصنيف الجامعة حسب الأداء الأكاديمي"URAP"، تقريراً سنوياُ وعالمياً يتضمن تصنيف الجامعات والكليات لأفضل مؤسسة تعليمية ومقاييس علمية ترتكز على البيانات المتوفرة من المعلومات العلمية ومؤشرات الأداء البحثي، بما فيها عدد المقالات والاقتباسات ومجموع الوثائق والتعاون الدولي. بالنسبة إلى الترتيب العالمي، تعمل الاكاديمية على نشر ترتيب إقليمي للجامعات باستخدام مؤشرات إضافية كعدد الطلبة وأعضاء هيئة التدريس كما احتلت جامعة صفاقس من أحسن 744 جامعة بالعالم والحادية عشر افرقيا والثانية وطنيا بعد جامعة تونس المنار. ويعود هذا التصنيف في عدة مجالات من أهمها المرتبة الرابعة في مجالي الزراعة والعلوم البيولوجية، والخامسة في الهندسة والكيمياء والاعلامية ، والسادسة في مجالات الأعمال والادراة والمحاسبة ،والسابعة في الرياضيات ، فيما احتلت المرتبة الثامنة في مجالات البيوكيماء والبيولوجيا وفق الاختصاصات المتوفر بكلية العلوم والمدرسة الوطنية للمهندسين بصفاقس.