Le repos biologique, dans le domaine de la pêche qui coïncide avec l'apparition de regroupement de variétés de poissons de petite taille dans de faibles profondeurs, consiste en l'arrêt obligatoire d'une ou de plusieurs activités de la pêche durant une période ne dépassant pas trois mois renouvelable. Ce repos vise à mettre fin aux infractions de la pêche anarchique et à permettre aux petits poissons de poursuivre leur croissance et de se reproduire. A ce sujet, la Tunisie compte parmi les rares pays méditerranéens ayant adhéré au système du repos biologique dans le domaine de la pêche et créé un fonds pour son financement. Il s'agit du fonds de développement de la compétitivité dans le secteur agricole qui octroie des aides matérielles aux pêcheurs durant la période de repos, fixée en Tunisie à trois mois renouvelable.
Au rayon des actions menées au cours de la dernière décennie, la promotion de la recherche scientifique, l'élaboration d'analyses au sein de laboratoires pour fournir d'amples informations sur la dispersion géographique des ressources halieutiques, outre les mesures à caractère organisationnel, institutionnel et de sensibilisation. Il s'agit, également, de renforcer le programme de lutte contre la pêche anarchique, à travers l'intensification des moyens de contrôle et la mise en place d'environ 7000récifs artificiels dans des zones maritimes sensibles du Golfe de Gabès. Ce faisant, la période de repos biologique a été fixée à 3 mois dans les zones menacées et la création d'un fonds pour le financement de ce repos figurent parmi la panoplie de mesures présidentielles décidées en vue de préserver les ressources halieutiques et promouvoir le secteur de la pêche en général. Le repos biologique est appliqué à l'activité de pêche dans le Golfe de Gabès au cours des mois juillet, août et septembre, l'objectif étant de permettre la reproduction des espèces matures, protéger certaines espèces lors de la période post-reproduction et limiter l'activité de pêche des espèces de fond.
Ce repos est financé à travers le fonds de développement de la compétitivité du secteur de l'agriculture et de la pêche. Pour l'année 2009, le nombre des embarcations adhérant à ce système a atteint au cours de la saison actuelle 171 embarcations de pêche à la traîne. Ces embarcations (167 au port de pêche de Sfax, 2 au port de Chebba et 2 autres au port de Zarzis) ont suspendu leurs activités au cours de la période de repos biologique. Les autres embarcations se sont déplacées pour poursuivre leurs activités en dehors du Golfe de Gabès.
Environ 1765 marins pêcheurs ont bénéficié d'aides financières, d'un montant de près de 2,5 millions de dinars, accordées en compensation de l'arrêt des activités de pêche.
Il est à rappeler que le système du repos biologique a été appliqué pour la première fois en 2006 pour une période de 45 jours. Pendant cette période, les activités de pêche ont été interdites dans toute la zone maritime de Ras Kaboudia, dont la situation est exceptionnelle car elle représente l'intersection de la zone de pêche du poisson bleu et celle du poisson blanc.
Pour couronner les résultats positifs de cette expérience, le Chef de l'Etat a ordonné, le 19 décembre 2008, lors d'un conseil ministériel, la prorogation de la durée de ce repos et la création d'un fonds pour son financement afin d'appuyer les efforts de production des richesses halieutiques et d'encourager les marins pêcheurs à adhérer à ces dispositions.