كشف وزير الصحة عبد اللطيف المكي أنّ تعيين محمد الشاوش على رأس إدارة رعاية الصحة الأساسية خضع للكفاءة وليس للانتماء الفكري أو السياسي. ونفى في حوار بث اليوم الثلاثاء 20 افريل 2020 على القناة الوطنية، علمه بانتماء الشاوش لحركة النهضة من عدمه، مشيرا إلى أنّ التعيينات في وزارة الصحة لا تتم عن طريق الولاء الحزبي بل عن كفاءة ومن ضمن أبناء القطاع الصحي حصرا. واكد عبد اللطيف المكي أن حمودة بنفسه هو من قدم توصية بتعيين الشاوش في مكانه، وبقية المدراء في الوزارة وافقوا على القرار وقدموا تقييما إيجابيا عن الشاوش مما جعل وزير الصحة يقتنع بتعيينه. جدير بالذكر أن تعيين محمد الشاوش على رأس ادارة الرعاية الصحة الاساسية أثار جدلا بسبب بعض التدوينات التي وصف الرجل بكونه “معاد للدولة المدنية”. وكانت رئيسة الحزب الدستوري الحر عبير موسي قد عبّرت عن اعتزامها التوجه للقضاء لتقديم شكايتين برئيس الحكومة إلياس الفخفاخ ووزير الصحة عبد اللطيف المكي. واعتبرت أن تعيين وزير الصحة لمحمد الشاوش خلفا لشكري حمودة هو “بمثابة جريمة”، حسب قولها.