في مقابلة خاصة اجراها الرئيس المؤقت و المرشح للانتخابات الرئاسية في دورتها الثانية المنصف المرزوقي مع وكالة الأناضول، أبدى فيها استعداده للتعاون مع الحكومة التي ينتظر ان يشكلها حزب نداء تونس الفائز بالانتخابات التشريعية الأخيرة. وحول المخاوف من عدم الانسجام بينه كرئيس للدولة وحكومة يترأسها نداء تونس، قال المرزوقي "إنني كرجل مسؤول سأتعامل مع هذه الحكومة في إطار ما يحدده الدستور، ففي نفس الحزب تجد صراعات ولكن الناس يتعايشون مع بعضهم البعض ويمكن أن يكون نفس الشيء بين رئيس الجمهورية ورئيس الحكومة". وحول ما وقع مؤخرا من وفاق بين حركة النهضة ونداء تونس في انتخابات رئاسة مجلس نواب الشعب الأسبوع الماضي قال المرزوقي " هذا شيء ايجابي ونحن لا نريد إلا أن تتفاهم الأطراف السياسية مع بعضها البعض، أن تكون هناك حكومة وحدة وطنية تمثل كل الأطراف ضروري جدا لتخفيض الاحتقان السياسي، وكل ما يخفض الاحتقان نحن معه". وتحدث المرزوقي عن برنامجه قائلا: هو "مرتبط بما يسمح به الدستور الذي يعطيني جملة من الصلاحيات سياسيا، كالمحافظة على الدستور الذي سأدافع عنه بكل قواي للمحافظة على الحريات وعلى الوحدة الوطنية وقصر قرطاج سيبقى دائما وأبدا مكانا للحوار، والحوار الوطني سيتواصل". وأضاف المرزوقي "من الناحية الأمنية كرئيس للمجلس القومي للأمن لي صلاحيات، لي قضية الأمن القومي بمفهومه الواسع وليس بمفهومه الضيق المفهوم العسكري الأمني فقط بل أمن الغذاء وأمن الطاقة وأمن الماء". واعتبر المرزوقي ان منافسه في الانتخابات الرئاسية الباجي قايد السبسي يستخدم آلة النظام القديم وأوضح "طبعا الجميع يعرف ان الآلة التي تشتغل بها الحملة الرئاسية لمنافسي هي آلة الحزب المنحل قانونا، وهذا الجميع يعرفه، وهذا حق من حقوقه وأنا كنت ضد قانون لإزاحة هؤلاء أو لمنعهم من الترشح لأنني كديمقراطي اعتبرت هذا غير ديمقراطي، لكن الآن من الديمقراطية أن يصير نقاش واضح حول ما هو هذا المشروع الجديد أنا أقول هذا هو النظام القديم بعقليته بتقسيمه للمجتمع بأفكاره القديمة وأنا ضده وهذا حق من حقوقي أن أكون ضده والشعب يفصل بيننا إذا الشعب قبل بعودة المنظمة القديمة سأقبل قراره لكن من حقي في الحملة الانتخابية أن أنبه التونسيين". وعن الاتهامات التي وجهها إليه خصومه بأنه يلقي تأييد تيار السلفية الجهادية، عقب المرزوقي "هذه اتهامات مبنية على مواقف خاطئة ولا ترقى إلى الحقيقة وهي آتية من الخصم لسبب بسيط أن القول بان المليون و100 ألف تونسي الذين صوتوا لي كلهم لهم علاقة بالجهاديين والعنف" هو قول خاطئ. وأضاف: "الجميع يعرف أن الجهاديين لا يصوتون وكل ما في الأمر انه تمّ استغلال صور لبعض الناس الذين أرادوا المشاركة في حملتي وهم مواطنون سلِّط عليهم الضوء ولم يُسلط الضوء على رجال الأعمال الكثيرين والمثقفين الكثيرين واليساريين الكثيرين الذين يساندونني وكذلك النساء من الطبقات البورجوازية الناشطات في حملتي في صفحات الفيسبوك".