قدم رافع بن عاشور المستشار لدى رئيس الجمهورية استقالته ابتداء من 1 أفريل 2015 و قد تم قبولها بمقتضى أمر رئاسي عدد 66 لسنة 2015 مؤرخ في 31 مارس 2015 وفق ما ورد في الرائد الرسمي يوم 7 أفريل 2015. وتآتي هذه الاستقالة لتعارضها مع منصب رجل القانون رافع بن عاشور كقاض في المحكمة الافريقية ، وهو تعارض كان المستشار السابق يعلمه عند قبوله المنصب الرئاسي وكان صرح أنه سيختار الاستقالة من المحكمة الافريقية ليحتفظ بمنصب المستشار القانوني لرئيس الجمهورية.