يعود تاريخ بناء جامع الزيتونة إلى سنة 114ه/732م. على يد عبد الله ابن الحبحاب مكان بناية عتيقة كان الفاتح حسّان بن النعمان قد حول البناية إلى مصلى سنة 79ه/698 م. وقد أعيد بناء جامع الزيتونة سنة 250ه/ 864م. وكان ذلك في عهد الأمير الأغلبي أبو إبراهيم أحمد (242ه/863م – 249ه/863م) بأمر من الخليفة العباسي وبتصميم من البناء الشهير "فتح" اللذي نحت اسمه على قبة المحراب. وفي سنة 380ه/990م. أمر الحاكم الزيري المنصور ببناء قبة البهو فوق مدخل قاعة الصلاة المطلة على البهو. وقد سجل الخرساني أبو محمد عبد الحق اسمه على الباب المطل على سوق العطارين. وفي سنة 716ه/1316م. تمت أول عملية ترميم هامة : فقام أبو يحيا بتغيير بعض الروافد وبإتقان الأبواب التي مازالت موجودة إلى اليوم والملحقات. وبعد الاحتلال الإسباني أمر الإمام تاج العارفين البكري بترميم المعلم وبتجميل المحراب وما جاوره. كما يعود إليه الفضل في بناء البهو الشرقي المطل على سوق الفكة وذلك سنة 1047ه/1637م. وفي سنة 1063ه/1652م أعاد حمودة باشا بناء المئذنة التي استبدلت سنة 1309ه/1896م بمئذنة جديدة يبلغ ارتفاعها 43 م وكانت من إنجاز الأمينين في البناء الطاهر بن صابروسليمان النيقرو. وقد بلغت التكاليف الجملية 110.000 فرنك متأتية من أموال الحبس وقد رفع الآذان إلى الصلاة من أعلى هذه المئذنة لأول مرة في 26 رمضان 1312ه/1894 م وكان ذلك بحضور الملك علي باي الثالث. وبعد الاستقلال أذن الرئيسان بورقيبة وبن علي بإجراء عمليات ترميم وصيانة هامة خلال الستينات ثم التسعينات. وقد كان هذا المعلم الديني الجليل مقر الجامعة الزيتونية وقد ساهم في تكوين أجيال من المثقفين كان البعض منهم من رواد النهضة العربية الإسلامية الحديثة. كما تم بعد الاستقلال, نقل الدروس التي كانت تقدم بجامع الزيتونة إلى كلية الشريعة وأصول الدين ومنذ سنة 1988, إلى مبنى جامعة الزيتونة.
