دخلت جامعة صفاقس في سنة 2020 في تصنيف أفضل الجامعات في الاقتصادات الناشئة في جميع أنحاء العالم كشف عنه التصنيف الدولي من قبل مجلة “التايمز للتعليم العالي و الجامعات”. كما دخلت جامعة صفاقس في المرتبة 300 وفق مؤشر الصناعة والابتكار والبنية التحتية 2020, والمرتبة 600 عالميا من ناحية الجامعات المؤثرة في محيطها وفق التصنيف الدولي “التايمز للتعليم العالي و الجامعات”. ويتم التوصل إلى هذه التصنيفات وفق مقاييس علمية ترتكز على البيانات المتوفرة من المعلومات العلمية ومؤشرات الأداء البحثي، بما فيها عدد المقالات والاقتباسات ومجموع الوثائق والتعاون الدولي وجميع مهامها الأساسية ، وهي التدريس والبحث ونقل المعرفة والمناظير الدولية ، أو السمعة الدولية.