Le juge d'instruction du 12ème bureau du tribunal de première instance de Tunis a émis dans la journée du vendredi 27 septembre 2013 deux mandats de dépôts contre les deux individus accusés d'avoir planifié l'explosion de la radio Jawhara FM à Sousse et de collaborer avec des parties étrangères. Le ministère public considère cette affaire de nature terroriste et son examen basé sur les lois internationales de lutte contre le terrorisme, revient donc au tribunal de première instance de Tunis. Le ministère public avait auparavant autorisé l'arrestation des deux accusés notamment Aymen Ben Ammar activiste du mouvement Ennahdha et leur mise en garde à vue avant de comparaitre devant le juge d'instruction de Tunis.