كثيرة هي المشاكل القائمة في المستشفى الجامعي الحبيب بورقيبة ، متعدّدة و متنوّعة سواء على مستوى البنية التحتيّة والمرافق الصحيّة فيه ، أو على مستوى إسداء الخدمات ،،، مستشفى الحبيب بورقيبة الذي يعدّ مكسبا وطنيّا هامّا خصوصا أنّه يستوعب قاصديه من داخل ولاية – بحجم ولاية صفاقس- و كذلك ما يضطلع به من عبء إضافي من الولايات المجاورة ،،، لكن مع هذه الأهميّة القصوى فإن هذه المؤسّسة تعاني الكثير من النّقائص ، نقائص بالجملة و حسّاسة تؤدّي إلى ضعف في سير حركة المؤسّسة ينتج عنه تردّيا واضحا و مزمنا إن لم نقل يقارب الشّلل على مستوى الخدمات الصحيّة التي من المفروض أنّه يقدّمها لزائريه ،، آخر هذه النّقائص : حفرة كبيرة في سقف مقابل لقسم العلاج الطبيعي – طابق تحت أرضي – ، هذه الحفرة أو الثقب الكبير تناثرت مكّوناته على الأرضيّة ، كما كشف عن خور كبير على مستوى أنابيب الصرف الصحّي و مسالك توزيع المياه ،، طبعا هذه الحفرة لم تكن وليدة اليوم ، بل أنّ هناك تسرّبا و خللا في هذه المواسير أزمن و طال عهده حتّى كانت هذه هي النّتيجة التي لا تليق بمؤسّسة صحيّة أول شعاراتها التي تمثّلها و تنادي بها هي : النّظافة !! يُذكر أنّ مستشفى الحبيب بورقيبة يشهد منذ وقت بعيد تواتر البناءات الجديدة و ( المرمّات ) على مدار السّنين لكنّ ذلك لا يشمل الإصلاح و الترميم بالشكل المطلوب…