Le procureur de la République près du tribunal de première instance de Tunis a décidé, le 8 juin 2017, d'ouvrir une enquête concernant l'Instance supérieure indépendante pour les élections (ISIE). Le procureur se base sur le rapport de la cour des comptes qui avait pointé certains dépassements dans la gestion de l'instance et sur la plainte déposée par l'avocat Fathi Laâyouni. L'enquête a été confiée à la première brigade centrale de la Garde nationale à l'Aouina.
Les soupçons portent sur de la mauvaise gestion, pointée par la cour des comptes et sur la dilapidation de deniers publics, objet de la plainte de Me Laâyouni.