التقى رئيس الجمهورية المؤقت محمد المنصف المرزوقي، صباح اليوم الخميس 11 سبتمبر 2014، بمقر الفاتيكان بقداسة البابا فرانسيس وتمحور اللقاء حول المسار الانتقالي الديمقراطي في تونس وطرق ترسيخ مفاهيم التعايش بين المسلمين والمسيحيين. وأشاد البابا فرنسيس خلال هذا اللقاء، حسب بلاغ صادر عن رئاسة الجمهورية، بنجاح التونسيين في استكمال مسارهم الانتقالي، مبديا إعجابه بتوصلهم للمصادقة على دستور ينص على حرية المعتقد والضمير. وشدد رئيس الجمهورية وقداسة البابا على إدانتهما الشديدة لما يتعرض له المسيحيون العراقيون من اعتداءات من تنظيم داعش، مؤكدين على ان ما يقترفه هذا التنظيم لا يمثل مطلقا تعاليم الدين الاسلامي السمحة التي أكدت على التعايش بين المسلمين والمسيحيين. وقبل قداسة بابا الفاتيكان الدعوة التي وجهها له المرزوقي، خلال هذا اللقاء، لزيارة تونس، مؤكدا انه سيقع تحديد موعدها لاحقا.