تم ضبط الهيكل التنظيمي للوكالة الوطنية للمصادقة الالكترونية بالعمل على أساس بطاقات تصف بكل دقة المهام الموكلة لكل مركز عمل بالوكالة . و تدعى الوكالة إلى وضع دليل للإجراءات يضبط القواعد المتبعة للقيام بكل مهمة تندرج ضمن مشمولات كل هيكل على حدة و علاقات الهياكل فيما بينها . هذا و يتم تحيين الإجراءات كلما دعت الحاجة لذلك. و للإشارة فان الوكالة الوطنيّة للمصادقة الإلكترونية هي سلطة المصادقة الجذر في تونس، وتمثل أعلى مستوى الثقة في مجال المصادقة الإلكترونية وسلامة المعاملات والمبادلات الإلكترونية.وقد تمّ إحداث الوكالة الوطنيّة للمصادقة الإلكترونية بموجب القانون عدد 2000 - 83 المؤرّخ في 9 أوت 2000 والمنظم للمبادلات والتجارة الإلكترونية. وتعمل الوكالة الوطنيّة للمصادقة الإلكترونية من خلال الخدمات التي تقدمها على إيجاد مناخ ثقة وسلامة للتبادل عبر الأنترنات. وتهدف المصادقة الإلكترونية إلى ضمان سلامة المبادلات الإلكترونية وهي تغطي مجالات عدّة مثل التجارة الإلكترونية والإدارة الاتصالية والخدمات البنكيّة اللامادية.