باعتباره محدثا مؤخرا عرف معهد البئر الأحمر بتطاوين بعض الاشكاليات في بداية افتتاح السنة الدراسية الحالية و تتعلق بعدم التحاق البعض بمقاعد الدراسة و لئن تم حل اشكال تلاميذ وادي الخيل مع النقل فان رغبة البعض في مغادرة المعهد الذين انتقلوا اليه باعتبار بعده عن مقر السكنى او لأسباب خاصة عطلت السير العادي للدروس.و قد اشار مدير المعهد الى السعي الحثيث لحل هذه الاشكاليات.