أضحت معظلة التلوث في ولاية بنزرت أم المشاكل التي يعاني منها سكان الولاية خاصة مع ورود تقارير تفيد بتطور معدلات اصابة قاطني الولاية بأمراض مزمنة . وأظهرت أرقام الجمعية التُونسية للصحة و البيئة أن أكثر من 15 ألف مواطن من مدينة بنزرت أصيبوا بأمراض سرطانية و أورام خبيثة خلال سنة 2010 بسبب التلوث البيئي بالجهة و أشارت نفس الأرقام أن نسب الأمراض السرطانية تطورت منذ سنة 2007 التي كانت لم تكن تتجاوزال5 آلاف حالة . كما بينت نفس الدراسة أن عدد المصابين بالقصور التنفسي بالجهة تطور بدوره منذ سنة 2007 الذي لم يكن يتجاوز بدوره ال5 آلاف حالة , ليصل سنة 2010 لأكثر من 30 ألف مُصاب بهذه الأمراض المُزمنة . وكانت جمعيات بيئية قد نبهت الى الاخلالات البيئية في نشاط مصنع السكر ببنزرت رغم مكانته الاستراتيجية والابعاد التنموية للمشروع. وأشارت الجمعيات في تقارير أنه بسبب غياب مخبر التحاليل يقوم المصنع بتصريف ما يقارب 300 متر مكعب من المياه الملوثة في قنوات غير سليمة ومتخفية بين البناءات لتصب اخر الامر في بحيرة بنزرت ذلك الى جانب أن أشغال الحماية من الحرائق وحنفيات الحريق وشبكة الرغوة بالمصنع تبقى غير جاهزة. وأضافت أن مصنع السكر يتخلص من الفواضل في مواقع غير مهيأة وفي بحيرة بنزرت مع القاء الاكياس على الطريق بكميات هامة وفي أماكن خارج التجمعات السكنية. في السياق نفسه شهد الرصيف البحري المطل على مصنع السكر بقنال بنزرت أمس الأربعاء 25 ماي 2016 تسرب كميات من البترول الخام. وقامت مصالح الحماية المدنية ببنزرت مستعينة بمصالح الميناء التجاري بالتدخل الفوري لمعالجة هذا التسرب في الإبان ومنع مزيد انتشاره في مياه بحر القنال ببنزرت ، وفق تأكيد العقيد خميس بن علي المدير الجهوي للحماية المدنية ببنزرت. وأضاف المصدر ذاته أن مساحة البترول الخام التي تسربت بالموقع تم السيطرة عليها ولم تتجاوز رقعة التسرب ال250 متر حيث تم محاصرتها في الإبان من خلال تركيز حواجز عائمة بالمكان وبالتالي السيطرة عليه في انتظار فتح تحقيق في أسبابه المباشرة . وكان البنك الاوروبي لإعادة الاعمار والتنمية، قد منح في وقت سابق، تونس قرضا بقيمة 20 مليون أورو (43 مليون دينار) للمساهمة فى تمويل مشروع ازالة التلوث ببحيرة بنزرت. وسيوضع القرض على ذمة الديوان الوطني للتطهير للشروع في تنفيذ مشروع ازالة التلوث ببحيرة بنزرت الذي تبلغ كلفته الجملية 90 مليون اورو يساهم في تمويلها البنك الاوروبي للاستثمار بقيمة 40 مليون اورو الى جانب منحة يقدمها الاتحاد الاوروبي بقيمة 15 مليون اورو في إطار الية حسن الجوار. وسيخصص هذا القرض لتعصير شبكات التطهير في ثلاث محطات تطهير ببنزرت ومنزل بورقيبة وماطر واعادة تهيئة 17 محطة ضخ وتركيز 100 كلم من قنوات التطهير ببنزرت ومنزل عبد الرحمان ومنزل جميل ومنزل بورقيبة وتينجة وماطر.