بعد قرار الحكومة المؤقتة القاضي بانتخاب رؤساء جامعات التعليم العالي ، صدر مرسوم ينظم هذه العملية وشروطها ومدتها ، فنص المرسوم على أن يدير كل جامعة رئيس جامعة ينتخب من بين أساتذة التعليم العالي أو الرتب المعادلة, وعند تعذر انتخابه وفقا لشروط سيتم ضبطها يتم تعيينه. وحددت مدة رئاسة الجامعة ب3 سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة. ويساعد رئيس الجامعة، حسب الحاجة، نائب واحد وعند الاقتضاء نائبان اثنان, ويتم اختيار النائب عن طريق الانتخاب إلا في حالة تعذر ذلك يتم تعيينه وفقا لشروط سيتم ضبطها, ويسمى نائب رئيس الجامعة بأمر لمدة 3 سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة. كما نص المرسوم أن يدير الكليات عمداء ويدير المدارس والمعاهد العليا مديرون وينتخبون من قبل المدرسين القارين لمدة 3 سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة, وعند تعذر انتخابهم يتم تعيينهم.