La découverte de plusieurs cartons contenant des documents relatifs à la situation sécuritaire en Tunisie, au fonctionnement du ministère de l'Intérieur et à des enregistrements, des rapports concernant des personnages publics et figures de la scène politique et un équipement de surveillance, avait chamboulé l'opinion publique. Cet événement a représenté le point de départ de ce qui avait été appelé par la suite l'affaire de l'appareil secret d'Ennahdha, une sorte de police secrète et de réseau d'espionnage composés de civils, de policiers, ainsi que d'un ancien militaire. Le plus connu des agents de cette structure était Mustapha Khedher, ancien militaire jugé dans le cadre de l'affaire de Barraket Essahel. Ce dernier était donc déjà connu de la justice tunisienne. Suite à cette affaire, 93 militaires dont Mustapha Khedher avaient écopé de peines de prison et ont été révoqués de l'armée pour avoir organisé un coup d'Etat contre Ben Ali. La découverte de ces documents et du matériel, en plus de l'arrestation de Mustapha Khedher, en décembre 2013, avait eu lieu dans un climat tendu. Elle survient après plusieurs attentats terroristes et les assassinats politiques de Chokri Belaïd et Mohamed Brahmi, deux opposants au mouvement Ennahdha. Mustapha Khedher, d'après les informations collectées, jouait un rôle important au sein de cet appareil secret. Il était le coordinateur et le chef d'un réseau d'indicateurs et d'informateurs dont des policiers. L'enquête a, également, dévoilé que Mustapha Khedher était en contact avec l'homme d'affaires Fathi Damak qui avait été enregistré alors qu'il expliquait son plan pour l'assassinat d'hommes d'affaires et de personnalités politiques. Il y avait, aussi, des preuves de relations proches entre cet appareil secret et certains membres de la Ligue de protection de la révolution (LPR) et Ansar Chariâa, deux organisations souvent présentées comme étant des milices au service du mouvement Ennahdha. Cette structure avait été publiquement défendue par Rached Ghannouchi, président du mouvement Ennahdha. Mustapha Khedher était, aussi, en contact avec Ameur Balâazi, individu ayant dissimulé l'arme utilisée dans les assassinats politiques de Belaïd et Brahmi. Le président du mouvement Ennahdha, Rached Ghannouchi a été directement accusé par le comité de défense et des figures de l'opposition politique d'être le véritable leader de l'appareil secret. L'affaire de l'appareil secret du mouvement Ennahdha est surtout connue pour sa lenteur, la stagnation de l'enquête et les nombreux cris de détresse et de révolte du comité de défense des affaires des assassinats de Belaïd et de Brahmi. Le comité avait affirmé l'existence de liens entre l'appareil secret, le mouvement Ennahdha et un réseau de magistrats. Mustpaha Khedher avait fait face à des accusations de meurtre par le juge d'instruction près du tribunal de première instance de Tunis. Cette affaire avait révélé par la suite l'un des plus grands fiascos de la justice tunisienne, celui de l'affaire de l'ancien procureur de la République près du tribunal de première instance de Tunis 1 et ancien chef des pôles judiciaires financier et de lutte contre le terrorisme, Béchir Akremi. Le comité de défense dans les affaires des assassinats a révélé que ce dernier avait manipulé et dissimulé des preuves et des éléments de l'enquête des assassinats. Il aurait étouffé plus de 6.000 dossiers portant sur des affaires terroristes. Il serait responsable d'entrave à la justice. Ces affaires évoquaient continuellement une relation entre des groupes de terroristes ou des personnes de retour de zones de conflits, des figures ou des membres du mouvement Ennahdha, Mustapha Khedher désormais connu comme le coordinateur de l'appareil secret et des membres de Ansar Chariâa et des LPR. A titre d'exemple, nous pouvons rappeler que Boubaker Hakim, désigné comme auteur de l'assassinat de Mohamed Brahmi, était en contact direct avec Mustapaha Khedher par le biais d'un proche qui jouait le rôle d'intermédiaire. Encore une fois, les liens entre le mouvement Ennahdha, l'appareil secret sous la coordination de Mustapha Khedher, les attentats terroristes et les assassinats politiques ont été renforcés et les liens entre le numéro un du mouvement, Rached Ghannouchi et cette structure ont été cristallisés. Plusieurs anciens membres du Mouvement de la tendance islamique (MTI), devenu mouvement Ennahdha par la suite, avaient affirmé l'existence dans le passé d'une structure parallèle et d'un appareil secret au service du mouvement faisant office de police parallèle ou de milice. Nous pouvons citer parmi eux Karim Abdessalem ou Ahmed Ouergui. Les deux avaient insisté sur l'existence d'une telle structure. Ils ont expliqué qu'il s'agissait de l'une des bases de l'Islame politique et qu'elle était supervisée et contrôlée directement par les dirigeants du mouvement, à savoir Rached Ghannouchi. Karim Abdessalem avait, également, révélé que des membres de l'appareil secret d'Ennahdha avaient occupé le poste de conseiller au sein du ministère de l'Intérieur et de plusieurs autres administrations. Ainsi, Rached Ghannouchi avait été auditionné dans le cadre de cette affaire en 2019, avait révélé en octobre 2021, l'avocate Imen Gazeza dans une déclaration médiatique. En février 2022, le membre du comité de défense des martyrs Chokri Belaïd et Mohamed Brahmi, Ridha Raddaoui, avait annoncé qu'un certain Nejah Belhaj Ltaief jouait le rôle d'homme de main de Rached Ghannouchi et était impliqué dans ce grand réseau formé par le président du mouvement Ennahdha. Il serait chargé de la collecte de fonds à l'étranger et de leurs acheminements vers la Tunisie. Il a, aussi, affirmé que le réseau d'Ennahdha incluait une équipe chargée d'espionner des hommes politiques, de hauts cadres sécuritaires et des magistrats et que les enregistrements étaient remis à Rached Ghannouchi. L'ensemble de ces révélations et les enquêtes conduites par la justice tunisienne ont conduit à l'émission d'une interdiction de voyage à l'encontre du président du mouvement Ennahdha, Rached Ghannouchi. En effet, malgré le démenti de Maher Medhioub, la porte-parole du tribunal de première instance de l'Ariana, Fatma Boukattaya a affirmé que le leader historique et figure de l'Islam politique en Tunisie avait fait l'objet d'une telle procédure à la date du 27 mai 2022. Ces révélations nous amènent à nous interroger sur non-pas l'existence d'un appareil secret, mais sur l'étendue de ce réseau et sur les nombres de personnes et d'institutions de l'Etat compromises par cette opération. Le terme appareil secret a souvent été lié directement à Mustapha Khedher. Néanmoins, l'analyse de la situation nous montre qu'il n'était qu'un pion et qu'il ne contrôlait qu'une équipe ayant une tâche bien déterminée. Le réseau, la véritable structure parallèle à l'Etat ne se limitait pas à des opérations d'espionnage.
