La question des gros écarts entre les chiffres régionaux et le résultat officiel global de l'Instance supérieure indépendante pour les élections (Isie) est au centre d'une grande polémique en Tunisie. Le référendum, auquel s'oppose une partie de la scène politique, a accumulé les fiascos. La question de la publication de résultats régionaux ne concordant pas avec le nombre d'électeurs inscrits par région a suscité l'indignation et la colère des opposants au chef de l'Etat, Kaïs Saïed. Suite à la dénonciation de la chose, l'Isie avait retiré les résultats des votes publiés sur sa page Facebook pour ensuite publier un communiqué avançant un « problème de mise à jour ». En guise de réaction, le président de l'Isie, Farouk Bouasker, a décidé de limoger, à la date du 28 juillet 2022, le directeur exécutif de l'instance, Amor Bousetta. Le vice-président de l'Isie, Maher Jedidi, a, lui, assuré dans une déclaration médiatique, que des membres de la salle des opérations avaient été écartés en plus du chef de cabinet de l'Instance.
Or, plusieurs documents rendus publics montrent que les résultats avaient été validés par le président de l'instance avant leur publication. La signature de Farouk Bouasker peut être observée sur l'ensemble des documents publiés initialement par l'instance.
