L'instance Vérité & Dignité a rendu public un communiqué daté du 22 décembre 2015 dans lequel elle annonce le limogeage, pour la deuxième fois, de Zouheir Makhlouf, l'un des vice-présidents de l'instance. Selon le communiqué, le conseil de l'instance a accordé le droit à la défense à Zouheir Makhlouf selo l'article 79 du règlement intérieur. Le communiqué ajoute « le Conseil a constaté les manquements professionnels dont M. Makhlouf s'est rendu coupable, dont notamment la violation de la loi organique 53-2013 relative à l'instauration et l'organisation de la justice transitionnelle, et plus précisément les articles 27, relatif au serment, 31 relatif au devoir de réserve et à la préservation du secret professionnel, et 37 relatif à l'atteinte à l'image de l'Instance ». La décision du conseil de l'IVD est effective à partir du 21 décembre 2015.
Rappelons que Zouheir Makhlouf avait dénoncé plusieurs pratiques illégales ainsi qu'une mauvaise gestion des deniers publics de la part de Sihem Ben Sedrine, présidente de l'instance. Cela lui avait valu d'avoir été limogé une première fois, mais un jugement du tribunal administratif lui avait permis de retrouver son poste.