L'aviculture, l'apiculture et la cuniculture sont autant d'activités productives, en milieu rural, à Béja. Elles constituent les principales sources de revenu pour plusieurs familles. Ces activités qui font partie des traditions de la population de la région ont connu de nombreuses mutations leur permettant d'entrer dans le cycle de production de l'agriculture moderne, de participer à l'amélioration des conditions de vie et de fournir des opportunités d'emploi, en particulier dans les zones rurales et montagneuses de Béja. Dans l'apiculture, la région compte 16 mille ruches modernes en plus des 2500 ruches traditionnelles, produisant au total 120 tonnes de miel, par an, sans compter les produits dérivés. Le secteur cunicole compte, pour sa part, plus de 50 éleveurs utilisant des méthodes modernes, dans des exploitations familiales. L'aviculture, quant à elle, enregistre une grande concentration de petits éleveurs disposant d'unités d'une capacité maximale de 3000 volailles par élevage. C'est dans le sud de la région de Béja que l'élevage moderne enregistre le plus grand volume de production de viande de poulet et d'œufs. Ainsi, les délégations de Medjez El Bab et Goubellat fournissent, respectivement, 40% et 36% de la production totale de la région. Toutes ces filières bénéficient de l'encadrement des structures agricoles et professionnelles, ainsi que du suivi sanitaire. Des efforts sont, également, déployés pour le renforcement de l'élevage moderne, l'amélioration des circuits de distribution et la diversification des plantes mellifères dans les zones forestières et montagneuses.
