Elyes Chaouachi a indiqué qu'il faisait désormais l'objet de poursuites judiciaires dans le cadre de sept affaires liées au décret 54 et à la loi de lutte contre le terrorisme. Dans une publication Facebook du 24 juillet 2025, Elyes Chaouachi a révélé qu'il fait l'objet de quatre nouvelles affaires antiterroristes. Selon lui, il est ciblé en raison de ses positions. « Tout cela parce que je critique et je m'oppose au système qui oppresse mon père, mes camarades et les voix libres. Moi, un terroriste ? Jusqu'où avez-vous vidé le mot "terrorisme" de son sens, bande de lâches », a-t-il écrit. Elyes Chaouachi a indiqué qu'on utilisait l'antiterrorisme comme prétexte en raison de l'absence de véritables accusations. Il a, aussi, rappelé avoir récemment été victime d'une agression physique alors qu'il se trouvait à Lyon et a accusé le pouvoir en place d'être derrière cet acte. Pour rappel, Elyes Chaouachi est connu pour son opposition au processus du 25-Juillet. Il a émis plusieurs critiques à l'égard du président de la République, Kaïs Saïed et la ministre de la Justice, Leila Jaffel. Son père, Ghazi Chaouachi, dirigeant du parti Attayar, a été arrêté le 24 février 2023 et emprisonné depuis cette date. Il a été condamné à 18 ans de prison dans le cadre de la très médiatisée affaire de complot. Ce dossier, qualifié de monté de toutes pièces par la défense et dépourvu de preuves, vise plus d'une vingtaine de personnalités publiques.