La consultation régionale sur le plan directeur du Port BizerteMenzel Bourguiba à l'horizon 2020 (mardi 24 novembre 2009) a abouti à l'identification de plusieurs nouveaux projets. Il s'agit, pour l'essentiel, de quais spécialisés : un quai sucrier devant être relié à l'usine de raffinage de sucre en cours de réalisation, un quai cimentier, un quai minier destiné à acheminer du phosphate de Sra-ouertane au cas où la décision d'exploiter ce gisement serait prise, un quai pour les bateaux de plaisanciers et croisiéristes, un quai céréalier. Ces quais, pour peu qu'ils soient réalisés, viendront s'ajouter aux autres quais et ouvrages du port : un quai commercial (520 m), 2 quais pétroliers (400 m), un quai pour minerais (120 m), un quai pour les produits sidérurgiques (120 m) et quatre bassins ou cales sèches pour la maintenance et réparation des navires (arsenal de Menzel Bourguiba).
